Выполняется лечение пациентов с дисплазией тазобедренных суставов, врожденным вывихом и подвывихом бедра, последствиями острого гематогенного остеомиелита (патологический вывих и подвывих бедра, врожденные ложные суставы), болезнью Легга-Кальве-Пертеса, юношеским эпифизеолизом головки бедра, варусной и вальгусной деформацией проксимального отдела бедра, последствиями травм и асептического некроза головки бедра, коксартрозом различной этиологии.
Доброкачественные опухоли и опухолеподобные заболевания костей; множественные экзостозные хондродисплазии. Артроскопия крупных суставов.
Врожденные и приобретенные укорочения и удлинения конечностей.
Диспластические системные поражения костей скелета;
Ортопедические осложнения после перенесенного рахита и рахитоподобных заболеваний (фосфат-диабет, фиброзная дисплазия и др.);
Врожденная варусная деформация шейки бедренной кости (соха vага congenita).
Отделение ортопедии № 2 – единственное в Казахстане специализированное детское ортопедическое отделение, занимающееся лечением тяжелых деформаций нижних конечностей при редких врожденных, наследственных и системных заболеваниях опорно-двигательного аппарата:
• всех формах системных дисплазий скелета;
• синдромах Ларсена, Эллерса-Данло, Марфана;
• различных формах рахита и рахитоподобных заболеваниях;
• болезни Блаунта;
• Ортопедическое лечение детей с ДЦП;
• Коррекция деформации стопы и нижних конечностей при болезни Шарко-Мари-Тута, различных формах миопатий, полиневропатий.
С 2017 года проводится лечение ортопедических нарушений при мукополисахаридозах, муколипидозах и других болезнях накопления в составе мультидисциплинарной группы, включающей в себя педиатров, врачей лучевой диагностики, детских хирургов, анестезиологов-реаниматологов.
Отделение является первым в Казахстане по коррекции деформаций конечностей с помощью управляемого роста (8-plate).
В отделении проводится диагностика и комбинированное лечение больных с первичными злокачественными и метастатическими опухолями костей.

Пациентам с опухолевым и метастатическим поражением длинных трубчатых костей проводятся оперативные вмешательства в объеме резекции пораженных отделов с последующим замещением дефектов эндопротезами, массивными васкуляризированными аутотрансплантатами, замещение дефектов дистракционным остеосинтезом по Илизарову.